Прапор Ватикану прийнятий 7 червня 1929 папою Пієм XI в рік підписання Латеранських угод і створення незалежної держави Святого Престолу.

Прапор був створений за зразком прапора Папської області (зразка 1808) і являє собою квадратне полотнище, що складається з двох рівновеликих вертикальних смуг - жовтої і білої. У центрі білої смуги - герб Ватикану (два схрещених ключа під папською тіарою).