Прапор був створений редактором газети «La Verdad» (Правда) Мігелем Толон в 1848 році і спирався на дизайн американського зоряно-смугастого прапора. Зірка, що іменується «La Estrella Solitaria» (Самотня зірка), була обрана, щоб освітлювати шлях до свободи, і взята з прапора Техасу. З часом сам кубинський прапор став відомий як «Прапор Самотньої зірки» (ісп. La Bandera de la Estrella Solitaria). Прапор був піднятий вперше 19 травня 1850 в Карденасі, на північному березі Куби, де генерал Нарсісо Лопес (Narciso López) висадився з 600 соратниками і здійснив невдалу спробу звільнити острів від колоніального правління іспанців.

Трикутник - символ свободи, рівності і братерства, а три синіх смуги уособлюють три частини, на які розділили Кубу іспанці. Білий колір символізує чистоту прагнень революціонерів і справедливість, червоний - кров, пролиту в боротьбі за незалежність.